[发明专利]一种归一化并比较水平基因转移网络的方法在审
申请号: | 202211727781.5 | 申请日: | 2022-12-30 |
公开(公告)号: | CN115966250A | 公开(公告)日: | 2023-04-14 |
发明(设计)人: | 陈银;赵梓丞;李静 | 申请(专利权)人: | 深圳百人科技有限公司 |
主分类号: | G16B5/20 | 分类号: | G16B5/20;G16B30/00;G16B40/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518118 广东省深圳市坪山区坑梓街*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种归一化并比较水平基因转移网络的方法,包括以下步骤:S1:采用贝叶斯概率模型将HGT根据测序量进行归一化;S2:在HGT网络中,将每个基因组被表示为一个顶点,其中,如果HGT发生在两个基因组之间,则在两个顶点之间有一条边;S3:采用不同的分类级别对基因组序列进行注释,得到了不同分类等级的HGT网络;S4:通过图的密度、传递性、同配性和代数连通性几种拓扑性质对HGT网络进行分析。使用图密度、传递性、同配性和代数连通性来描述网络,并在不同组别间的样本中比较HGT网络,以对宏基因组和人体表型关联提供新的分析方向,通过计算多种拓扑属性来分析HGT网络,也能更加系统性地建模并分析宏基因组。 | ||
搜索关键词: | 一种 归一化 比较 水平 基因 转移 网络 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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