[发明专利]一种基于通量平衡分析的代谢网络关键因子挖掘方法在审

专利信息
申请号: 202211432147.9 申请日: 2022-11-16
公开(公告)号: CN115762663A 公开(公告)日: 2023-03-07
发明(设计)人: 刘娟;杨锋;杨志辉;张小蕾;张蔷 申请(专利权)人: 武汉大学
主分类号: G16C20/60 分类号: G16C20/60;G16C20/70
代理公司: 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 代理人: 李炜
地址: 430072 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种基于通量平衡分析的代谢网络关键因子挖掘方法。该方法不需要复杂的领域知识,通过输入代谢网络以及目标化合物,可以直接挖掘对目标化合物影响最大的多个反应,用于快速辅助生物学家优化的代谢网络。本发明首先对已有代谢网络进行建模,并且确定需要生产的目标产物,并依据FBA对代谢网络中可以产生目标产物的反应进行分析,进而使用基于遗传算法的最大通量变化计算方法来计算每个反应对目标代谢物通量对影响,并依次确定对通量影响最大的top‑k个代谢反应作为关键因子。本发明为代谢途径设计和优化提供了候选的关键因子。
搜索关键词: 一种 基于 通量 平衡 分析 代谢 网络 关键 因子 挖掘 方法
【主权项】:
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