[发明专利]一种分析配体-受体相互作用介导的细胞通讯方法在审

专利信息
申请号: 202211217739.9 申请日: 2022-09-30
公开(公告)号: CN115910212A 公开(公告)日: 2023-04-04
发明(设计)人: 彭利红;阳龙;谭经纬;周立前 申请(专利权)人: 湖南工业大学
主分类号: G16B35/20 分类号: G16B35/20;G16B40/00;G16B45/00;G16B50/00;G06N3/0442;G06N3/08
代理公司: 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 代理人: 杜梅花
地址: 412000 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种分析配体‑受体相互作用介导的细胞通讯方法,首先收集多个配体‑受体相互作用数据集,其次通过一种结合了异构牛顿Boosting模型和深度神经网络的异构深度集成模型来筛选识别潜在的配体‑受体相互作用,第三基于单细胞转录组数据对组织中已知和预测到的配体‑受体相互作用进行过滤,第四基于过滤后的配体‑受体相互作用和表达阈值法、表达乘积法和联合评分策略预测细胞通讯,最后对细胞通讯结果可视化,该框架进一步应用于分析人类黑色素瘤组织和头颈部鳞状细胞癌组织中的细胞通讯,本发明有助于肿瘤微环境中的细胞通讯预测,并进一步帮助抗癌药物设计和肿瘤靶向治疗。
搜索关键词: 一种 分析 受体 相互作用 细胞 通讯 方法
【主权项】:
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