[发明专利]基于LSTM的无描述符定量构效关系分类模型构建方法在审
申请号: | 202210920160.2 | 申请日: | 2022-08-02 |
公开(公告)号: | CN115240792A | 公开(公告)日: | 2022-10-25 |
发明(设计)人: | 刘静;李诗琪 | 申请(专利权)人: | 上海海事大学 |
主分类号: | G16C20/70 | 分类号: | G16C20/70;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 上海互顺专利代理事务所(普通合伙) 31332 | 代理人: | 刘珊珊 |
地址: | 201306 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
权利要求书: | 暂无信息 | 说明书: | 暂无信息 |
摘要: | 本发明提出一种基于LSTM的无描述符定量构效关系分类模型构建方法,包括步骤:S1、构建训练样本:收集化合物分子活性数据集,采用SMILES编码方式计算出每个化合物分子结构的SMILES字符串;对所述每个SMILES字符串进行分词处理,将分词结果先进行one‑hot编码,再将所述one‑hot编码转换为Word embedding词矩阵;为所述Word embedding词矩阵添加人工标记以区别活性化合物和非活性化合物,得到训练样本;S2、构建LSTM网络模型作为无描述符定量构效关系分类模型;S3、通过所述训练样本训练所述LSTM网络模型,直至满足收敛条件。本发明可以直接从化合物的SMILES线性文本构建和使用QSAR模型,而无需计算任何分子描述符,可以快速、准确的进行化合物分子活性预测。 | ||
搜索关键词: | 基于 lstm 描述 定量 关系 分类 模型 构建 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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