[发明专利]基于携带缓存Trie树加速生物基因的检索方法在审
申请号: | 202210451340.0 | 申请日: | 2022-04-26 |
公开(公告)号: | CN114758727A | 公开(公告)日: | 2022-07-15 |
发明(设计)人: | 徐淳;吴云志;乐毅;董梦龙;马志宇;陈佳玲 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G06F16/22;G06F16/2453;G06F16/2455;G06F16/2458 |
代理公司: | 安徽思沃达知识产权代理有限公司 34220 | 代理人: | 戴晓丹 |
地址: | 230000 安徽省合肥市蜀*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明公开了基于携带缓存Trie树加速生物基因的检索方法,属于数据查询技术领域,该检索方法具体步骤如下:(1)构建Tire树并将数据导入Tire树中;(2)对Tire树进行性能优化;(3)对基因序列簇进行缓存优化;(4)对Tire树查询效率进行对比分析;本发明通过构建Trie树与哈希表结合的方式对各组生物基因数据进行查询,能够利用有限的内存空间加速基因索引的检索。 | ||
搜索关键词: | 基于 携带 缓存 trie 加速 生物 基因 检索 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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