[发明专利]多核平台下BAM文件解析还原方法及系统有效
| 申请号： | 202210308495.9 | 申请日： | 2022-03-28 |
| 公开（公告）号： | CN114416666B | 公开（公告）日： | 2022-09-20 |
| 发明（设计）人： | 刘卫国;赵展;殷泽坤;闫立峰 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G06F16/16 | 分类号： | G06F16/16 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 张勇 |
| 地址： | 250101 山东*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种多核平台下BAM文件解析还原方法及系统，其属于生物信息技术领域，所述方案包括：获取待解析的BAM文件；通过读取线程对BAM文件进行读取，并通过若干解压线程对BAM文件进行并行解压，并将解压后的bam_block数据输入到第一任务队列；通过第一解析线程对所述第一任务队列中的bam_block数据进行简单解析，满足每个bam_block中包括一个或多个完整的bam1_t数据结构，并将解析后的bam_block数据输入到第二任务队列；通过若干第二解析线程对所述第二任务队列中的bam_block数据进行并行解析，获得bam1_t结构数据。 | ||
| 搜索关键词： | 多核 平台 bam 文件 解析 还原 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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