[发明专利]一种病毒基因识别和宿主预测的方法与系统在审
| 申请号： | 202210291560.1 | 申请日： | 2022-03-23 |
| 公开（公告）号： | CN114512182A | 公开（公告）日： | 2022-05-17 |
| 发明（设计）人： | 王颖;杨孜孜 | 申请（专利权）人： | 厦门大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 厦门福贝知识产权代理事务所(普通合伙) 35235 | 代理人： | 陈远洋 |
| 地址： | 361000 福建*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种病毒基因识别方法，包括：获取待测样本的宏基因组；获取预处理的宏基因组的k‑mer频度向量；构建三元组并输入到第一三元组网络进行训练，训练后的第一三元组网络使病毒与细菌的特征向量距离增大；将宏基因组的k‑mer频度向量输入训练好的第一三元组网络，从中识别出病毒序列。本发明还公开了一种宿主预测的方法，包括：获取病毒序列；获取病毒序列的k‑mer频度向量；构建三元组并输入到第二三元组网络进行训练，训练后的第二三元组网络使病毒与宿主细菌的特征向量距离减小，病毒与非宿主细菌的特征向量距离增大；将病毒序列的k‑mer频度向量输入第二三元组网络，从而匹配出病毒可能的宿主细菌。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 病毒 基因 识别 宿主 预测 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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