[发明专利]一种circRNA和miRNA关联关系高效预测方法在审

专利信息
申请号: 202210119428.2 申请日: 2022-02-08
公开(公告)号: CN114496084A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 邝祝芳;马志豪;张宇豪 申请(专利权)人: 中南林业科技大学
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B40/00;G16B50/00;G06K9/62
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 410004 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开一种circRNA和miRNA关联关系高效预测方法,包括如下步骤:1、下载circRNA、疾病与miRNA数据,构建circRNA与miRNA的邻接矩阵A;2、计算基于疾病和miRNA的circRNA高斯内核相似度矩阵CCIS和CMIS,计算circRNA的序列相似度矩阵CES;计算基于疾病和circRNA的miRNA高斯内核相似度矩阵MIS和MCIS;3、构建circRNA和miRNA的综合相似度矩阵CS和MS;4、基于Node2vec算法计算相似度矩阵CNS、MNS;5、分别把CNS、MNS与A拼接成特征矩阵CF、MF;6、基于0矩阵与邻接矩阵A构建异构邻接矩阵Acm;基于CF和MF构建异构特征矩阵CM;7、把异构邻接矩阵Acm与CM嵌入图注意力网络,基于talking‑heads与条件随机场算法进行编码,再通过完全矩阵分解算法进行解码得出最终得分矩阵进行预测。本发明是一种新的预测circRNA与miRNA关联方法。
搜索关键词: 一种 circrna mirna 关联 关系 高效 预测 方法
【主权项】:
暂无信息
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