[发明专利]一种基于变分贝叶斯的基因调控网络结构辨识方法在审
申请号: | 202210035654.2 | 申请日: | 2022-01-13 |
公开(公告)号: | CN114360641A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 刘切;王浩;李俊豪;柴毅 | 申请(专利权)人: | 重庆大学 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G06N7/00;G06K9/62 |
代理公司: | 重庆市嘉允启行专利代理事务所(普通合伙) 50243 | 代理人: | 胡柯 |
地址: | 400044 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | 本发明提供一种基于变分贝叶斯的基因调控网络结构辨识方法,根据不完整和有噪声的基因表达时间序列数据中考虑基因调控网络GRN的结构推断,用含有未知噪声信息的随机非线性状态空间模型,描述了基因表达数据中的动态行为,采用变分贝叶斯VB框架来同时估计参数和基因表达水平,通过生成预测值,可以很容易地处理缺失的观测值;考虑到GRN的稀疏性,利用极端梯度增强树对平滑后的基因数据进行建模,并通过树模型中的重要性得分来识别基因间的调控相互作用。该方法能在观测值缺失的情况下,有效地恢复GRN的调控相互作用,并优于现有的GRN识别方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 分贝 基因 调控 网络 结构 辨识 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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