[发明专利]一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型在审

专利信息
申请号: 202111493609.3 申请日: 2021-12-08
公开(公告)号: CN114420203A 公开(公告)日: 2022-04-29
发明(设计)人: 黄裕安;潘贵青;王佳;林秋镇;李坚强 申请(专利权)人: 深圳大学
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B10/00
代理公司: 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 代理人: 庄敏芳
地址: 518060 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开的一种用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法及模型,所述用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法是基于随机游走的异构图嵌入算法来预测TF与靶基因潜在的相互作用关系,采用随机游走方式在异构图中生成节点的语句,然后采用滑动窗口方式提取训练样本,经过异构图嵌入算法生成节点的特征,进而预测TF与靶基因之间未被发现的相互作用关系。并且,由于本发明在异构图中添加了TG节点,采用随机游走生成样本路径的过程中,在选择TG或者疾病节点时,设定一个概率,以一定概率选择TG或者疾病,在解决冷启动问题的同时,能够更好地捕获异构网络的节点信息。
搜索关键词: 一种 用于 预测 转录 因子 基因 相互作用 方法 模型
【主权项】:
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