[发明专利]基于免疫相关基因的MSI预测模型构建方法有效

专利信息
申请号: 202111481486.1 申请日: 2021-12-06
公开(公告)号: CN113921079B 公开(公告)日: 2022-03-18
发明(设计)人: 路顺;邓思瑶 申请(专利权)人: 四川省肿瘤医院
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B35/20;G16B50/00;G16H50/30;G16H50/50;G06K9/62
代理公司: 北京市领专知识产权代理有限公司 11590 代理人: 张玲
地址: 610042 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明涉及基于免疫相关基因的MSI预测模型构建方法,包括以下步骤:从癌症基因组图谱数据库中收集构建免疫相关MSI预测模型irMSIs的训练集和验证集;从免疫学数据库中选择免疫相关基因,并从中筛选出差异基因;根据筛选出的差异基因,通过LASSO逻辑回归算法构建免疫相关MSI预测模型irMSIs;使用免疫相关MSI预测模型irMSIs对预后风险进行验证。本发明提供了免疫相关基因在MSI状态预测上的应用,结合免疫相关基因,找到了一组可以在消化道肿瘤特别是结肠癌中稳定预测MSI的特征基因,并且能够很好的预测结肠癌预后风险。
搜索关键词: 基于 免疫 相关 基因 msi 预测 模型 构建 方法
【主权项】:
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