[发明专利]染色体三维结构重建方法及装置有效

专利信息
申请号: 202111097170.2 申请日: 2021-09-18
公开(公告)号: CN113808661B 公开(公告)日: 2022-06-10
发明(设计)人: 李防震 申请(专利权)人: 山东财经大学
主分类号: G16B15/00 分类号: G16B15/00;G06F17/16
代理公司: 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 代理人: 杨楠
地址: 250014 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明公开了一种染色体三维结构重建方法,包括以下步骤:将Hi‑C相互作用频率矩阵转化为距离矩阵D0;将距离矩阵D0补全,得到补全后的距离矩阵D1;按以下方法迭代求解染色体三维结构:步骤1、根据距离矩阵D1求解染色体三维结构S;步骤2、根据各基因组位点的空间位置计算出染色体三维结构S的固有距离矩阵D2;步骤3、利用D2D1进行修正,得到新的D1并转至步骤1;步骤4、满足预设条件后停止迭代并输出当前的染色体三维结构S。本发明还公开了一种染色体三维结构重建装置。本发明在ShRec3D算法基础上进行改进,利用重建出的染色体三维结构的固有距离矩阵对补全后距离矩阵进行迭代修正,从而在保持重建速度优势的前提下,大幅提高重建精度。
搜索关键词: 染色体 三维 结构 重建 方法 装置
【主权项】:
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