[发明专利]基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法有效
申请号: | 202111037346.5 | 申请日: | 2021-09-06 |
公开(公告)号: | CN113793637B | 公开(公告)日: | 2022-07-26 |
发明(设计)人: | 夏晓勤;石米娟;张婉婷;程莹寅 | 申请(专利权)人: | 中国科学院水生生物研究所 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G16B20/20;G16B20/50;G16B30/20 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 江丽丽 |
地址: | 430072 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法,包括以下步骤:获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息,根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵,获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合信息,以及对应的子代群体分组表型数据,构建子代组合基因型与对应子代表型的统计模型进行关联分析,获取表型与各SNP位点的关联P值;之后区分SNP位点的关联类型,计算是否符合加性或完全显性效应,对候选位点进行筛选;再根据全基因组SNP标记的LD衰减获得强相关标记的平均距离,用于最终标记集合的筛选。 | ||
搜索关键词: | 基于 亲本 基因型 子代 表型 基因组 关联 分析 方法 | ||
【主权项】:
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