[发明专利]一种植物成对NLR抗性基因数据库的构建方法及其多物种成对NLR基因数据库在审
| 申请号： | 202110931309.2 | 申请日： | 2021-08-13 |
| 公开（公告）号： | CN113628687A | 公开（公告）日： | 2021-11-09 |
| 发明（设计）人： | 田大成;秦超;杨四海;张小辉 | 申请（专利权）人： | 南京大学 |
| 主分类号： | G16B50/00 | 分类号： | G16B50/00;G16B30/00 |
| 代理公司： | 江苏银创律师事务所 32242 | 代理人： | 何震花 |
| 地址： | 210033 江苏*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种植物成对NLR抗性基因数据库的构建方法及其多物种成对NLR基因数据库。所述方法包括从JGI或Ensembl收集目的物种的基因组数据；通过Hmmscan和NLR‑parser工具鉴定NLR基因；结合基因注释信息筛选成簇NLR基因；通过Hmmscan和Blast工具分析NLR基因的特殊结构域；基于成对NLR基因的演化特征，通过Blast、Clustalw2、MEGA7.0等工具多轮检索目的物种的成对NLR基因；以成对NLR基因对应的特征值作为数据项标识建立成对NLR基因数据库。利用本发明提供的方法，可以对不同植物物种中的成对NLR抗性基因进行全基因组范围的检索和分析，为研究和改进作物的抗性育种提供了分子证据。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 植物 成对 nlr 抗性 基因 数据库 构建 方法 及其 物种 | ||
【主权项】：
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