[发明专利]一种基于序列频率信息识别DNA增强子元件的方法在审
| 申请号： | 202110907887.2 | 申请日： | 2021-08-09 |
| 公开（公告）号： | CN113593641A | 公开（公告）日： | 2021-11-02 |
| 发明（设计）人： | 郭菲;吕一诺;何文颖;唐继军;曹晶 | 申请（专利权）人： | 天津大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B40/00;G16B50/00;G06K9/62 |
| 代理公司： | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人： | 韩帅 |
| 地址： | 300072*** | 国省代码： | 天津;12 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于序列频率信息识别DNA增强子元件的方法，所述方法基于支持向量机构建的双层DNA增强子元件预测模型，所述预测模型通过如下步骤生成：步骤(1)：通过细胞系的染色质数据库信息构建DNA增强子序列数据集；步骤(2)：通过PSTNP算法对DNA增强子序列数据集进行处理获得具有位置特异性的三核苷酸序列的DNA增强子信息；步骤(3)：通过Kullback‑Leibler散度算法对DNA增强子信息的三核苷酸序列信息进行优化；步骤(4)：采用LASSO算法对DNA增强子信息的三核苷酸序列的特征数据进行降维处理；本发明解决了DNA增强子及其强度的预测问题，采用特征优化、特征筛选方法对提取的序列频率信息进行改进，明显提高了预测精度。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 序列 频率 信息 识别 dna 增强 元件 方法 | ||
【主权项】：
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