[发明专利]一种基于lncRNA对的结肠癌预后预测模型及其构建方法在审

专利信息
申请号: 202110905153.0 申请日: 2021-08-08
公开(公告)号: CN113421609A 公开(公告)日: 2021-09-21
发明(设计)人: 常庆;史俊峰;郝泽洲;梁鹏晨;曹励欧;何昌玉;蒋欣泉;朱正纲 申请(专利权)人: 上海市嘉定区中心医院
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B40/00;C12Q1/6886
代理公司: 上海太优知识产权代理事务所(普通合伙) 31352 代理人: 周长兴
地址: 201800 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种基于lncRNA对的结肠癌预后预测模型,从分子和免疫相关水平实现了结肠癌患者预后的风险分层。本发明公开了上述模型和模型构建方法,包括以下步骤:1)数据预处理,收集结肠癌原始基因表达数据和相对应临床数据,结合人类基因注释文件进行id转换,提取其中的lncRNA,再结合人免疫基因进行相关性分析,筛选出免疫相关的lncRNA;2)划分正常样品和肿瘤样本,进行差异性分析,提出具有差异的lncRNA,建立lncRNA对;3)使用单因素cox、lasso回归,多因素cox筛选预后预测模型参数,建立模型方程,并计算风险分数(riskscore),得到结肠癌预后预测模型;4)验证模型的优劣性。本发明可以显著地将高低风险的患者分开,进而可以预测结肠癌的临床结果,具有较高的临床应用价值。
搜索关键词: 一种 基于 lncrna 结肠癌 预后 预测 模型 及其 构建 方法
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