[发明专利]一种基于PHMM模型的差分可辨性基因序列聚类方法有效

专利信息
申请号: 202110738987.7 申请日: 2021-06-30
公开(公告)号: CN113380330B 公开(公告)日: 2022-07-26
发明(设计)人: 尚涛;任旭杰;杨英;姜亚彤;刘建伟 申请(专利权)人: 北京航空航天大学
主分类号: G16B40/30 分类号: G16B40/30;G16B30/00
代理公司: 北京慧泉知识产权代理有限公司 11232 代理人: 王顺荣;唐爱华
地址: 100191*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种基于PHMM模型的差分可辨性基因序列聚类方法,包括以下步骤:步骤一:初始化算法迭代轮数r=1;随机生成K个Profile HMM模型步骤二:计算序列数据对每个Profile HMM模型输出的分数,按最高分数将序列划分到相应的聚类;步骤三:确定该轮迭代差分可辨性隐私参数ρr;步骤四:计算每个Profile HMM模型的状态转移概率和发射概率;对计算得到的发射概率添加噪声;步骤五:计算每个Profile HMM模型与上一轮迭代时之间的散度距离,若散度距离的和小于预设的阈值,则输出聚类结果;否则迭代轮数r=r+1,并重复迭代执行步骤二~步骤五。本发明提供了基因序列数据聚类中的隐私保护以抵抗推理攻击,同时给出了隐私参数的迭代分配方法,使最终模型满足差分可辨性隐私定义。
搜索关键词: 一种 基于 phmm 模型 差分可辨性 基因 序列 方法
【主权项】:
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