[发明专利]一种circRNA和疾病关联关系的高效预测方法在审

专利信息
申请号: 202110492443.7 申请日: 2021-05-06
公开(公告)号: CN113178232A 公开(公告)日: 2021-07-27
发明(设计)人: 邝祝芳;马志豪 申请(专利权)人: 中南林业科技大学
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16H50/70
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 410004 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开一种circRNA和疾病关联关系的高效预测方法,包括如下步骤:1、在数据库网站下载circRNA数据、疾病数据;2、计算circRNA高斯内核相似度、circRNA基因相似度与circRNA的序列相似度、疾病高斯内核相似度、疾病语义相似度,分别为矩阵CIS、CGS、CES、DIS、DSS;3、构建circRNA综合相似度矩阵CS,构建疾病综合相似度矩阵DS;4、使用重启随机游走算法得到相似度矩阵CRS、DRS;5、分别把CRS、DRS与A拼接后使用PCA算法进行特征提取,得到特征矩阵CF、DF;5、根据CS、DS与邻接矩阵A构建异构邻接矩阵Acd;根据CF和DF构建异构特征矩阵CD;6、最后把Acd与CD使用图卷积神经网络进行分类预测。本发明是全新的预测circRNA与疾病关联的方法。
搜索关键词: 一种 circrna 疾病 关联 关系 高效 预测 方法
【主权项】:
暂无信息
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