[发明专利]一种circRNA和疾病关联关系的高效预测方法在审
申请号: | 202110492443.7 | 申请日: | 2021-05-06 |
公开(公告)号: | CN113178232A | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 邝祝芳;马志豪 | 申请(专利权)人: | 中南林业科技大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16H50/70 |
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地址: | 410004 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: |
本发明公开一种circRNA和疾病关联关系的高效预测方法,包括如下步骤:1、在数据库网站下载circRNA数据、疾病数据;2、计算circRNA高斯内核相似度、circRNA基因相似度与circRNA的序列相似度、疾病高斯内核相似度、疾病语义相似度,分别为矩阵CIS、CGS、CES、DIS、DSS;3、构建circRNA综合相似度矩阵CS,构建疾病综合相似度矩阵DS;4、使用重启随机游走算法得到相似度矩阵CRS、DRS;5、分别把CRS、DRS与A拼接后使用PCA算法进行特征提取,得到特征矩阵CF、DF;5、根据CS、DS与邻接矩阵A构建异构邻接矩阵A |
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搜索关键词: | 一种 circrna 疾病 关联 关系 高效 预测 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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