[发明专利]一种基于模块化识别的基因网络推理方法有效
申请号: | 202110309281.9 | 申请日: | 2021-03-23 |
公开(公告)号: | CN113066522B | 公开(公告)日: | 2022-07-12 |
发明(设计)人: | 张蔚;李心语;张建明;李光 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B40/00 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 刘静 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于模块化识别的基因网络推理方法。该方法将n个基因的表达信息作为训练集,其中每个基因有m个样本;采用ICA‑FDR算法对基因进行模块识别并将n个基因划分至不同基因模块中;基因模块内部的调控关系采用以梯度提升树为基础的算法进行推理,基因模块间的调控关系采用以稀疏回归为基础的算法进行推理,得出每个基因对的相关性得分;针对每个基因模块内与模块间推理得到的相关性得分分别进行归一化处理后合并,并按照得分降序排序得到最终基因调控网络。本发明为基因模块识别与基因网络推理提供了一个无缝衔接的融合框架,提高了基因模块识别的准确性,增加了基因调控网络功能的可解释性。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 模块化 识别 基因 网络 推理 方法 | ||
【主权项】:
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