[发明专利]一种环状RNA-RNA结合蛋白关系预测模型构建方法有效

专利信息
申请号: 202011575605.5 申请日: 2020-12-28
公开(公告)号: CN112562788B 公开(公告)日: 2022-06-28
发明(设计)人: 袁亮亮;杨旸 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/30;G16B20/00;G06Q10/04;G06N3/08;G06F40/289;G06F40/242
代理公司: 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 代理人: 孟旭彤
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种环状RNA‑RNA结合蛋白关系预测模型构建方法,解决了现有技术仅限制了预测准确率的问题,其技术方案要点是将初始的环状RNA序列数据集样本构造为环状RNA‑RNA结合蛋白序列对的形式;采用自监督学习的方式训练得到词向量字典;根据训练得到的词向量字典,将样本序列对映射成对应的词向量矩阵作为表征;将样本序列对的向量表征对应输入伪孪生网络,得到编码后的特征向量输入到度量函数中,计算绑定概率预测值并计算获得其与标签的差值,优化模型参数;模型训练迭代结束后保存得到的模型,本发明的环状RNA‑RNA结合蛋白关系预测模型构建方法,能针对RNA序列和蛋白质序列进行数据挖掘,能有效提高环状RNA‑RNA结合蛋白结合预测的准确率。
搜索关键词: 一种 环状 rna 结合 蛋白 关系 预测 模型 构建 方法
【主权项】:
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