[发明专利]lncRNA靶基因的预测分析方法、装置、设备和介质在审

专利信息
申请号: 202011294079.5 申请日: 2020-11-18
公开(公告)号: CN112201304A 公开(公告)日: 2021-01-08
发明(设计)人: 马贝贝;黄龙 申请(专利权)人: 上海美吉生物医药科技有限公司
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 李治东
地址: 201321 上海市浦东新区中国(上海)*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 本申请提供的一种lncRNA靶基因的预测分析方法、装置、设备和介质,通过统计每个处理中重复的mRNA表达量之和,并根据表达量过滤掉表达量之和为零的mRNA序列;对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析,并提取对应的相关性系数和概率P值作为相关性评判标准,以合并去冗余并分别以mRNA文件和lncRNA文件进行存储;对去冗余后的lncRNA序列按照指定序列数目进行拆分,以分别生成批量任务运行shell脚本,并提交至集群以实现多线程运行。本申请设置过滤方法减少lncRNA待预测的靶基因数量,减少了lncRNA靶基因预测假阳性率,从去除假阳性和多线程角度优化提升lncRNA靶基因预测效率。
搜索关键词: lncrna 基因 预测 分析 方法 装置 设备 介质
【主权项】:
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