[发明专利]构建肿瘤突变负荷TMB面板的方法有效
| 申请号： | 202010856670.9 | 申请日： | 2020-08-24 |
| 公开（公告）号： | CN111951893B | 公开（公告）日： | 2022-11-15 |
| 发明（设计）人： | 谢婵;彭亮;吴和维;郑杏容;高志良 | 申请（专利权）人： | 中山大学附属第三医院 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B40/00;G16H50/20;G16H50/70;C12Q1/6869;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 广州汇盈知识产权代理事务所(普通合伙) 44603 | 代理人： | 张蓓蓓 |
| 地址： | 510000 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了构建肿瘤突变负荷TMB面板的方法，包括下列步骤：1)获取肿瘤患者的转录组数据，分为高TMB组和低TMB组；2)筛选所述高TMB组和低TMB组两组间的免疫相关差异表达基因DEGs，并进行富集分析；3)通过ImmuneCellAI进行免疫细胞浸润分析，筛选出潜在的关键免疫细胞；4)筛选出与患者预后的肿瘤免疫相关基因；5)建立不同颜色的模块和可能影响预后的免疫性状的相关矩阵；6)选择WCGNA中与巨噬细胞、DC、MAIT和浸润积分具有较好相关性的基因，初步得到TMB‑IF基因面板。本发明还提供了肿瘤突变负荷TMB面板的使用方法。本发明构建出的肿瘤突变负荷TMB面板在使用时测序成本低，对DNA输入要求低，具有更短的周转时间，可进行更深层次的测序，提高突变检测灵敏度。 | ||
| 搜索关键词： | 构建 肿瘤 突变 负荷 tmb 面板 方法 | ||
【主权项】：
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