[发明专利]一种融合全局和局部拓扑结构的蛋白质复合体的检测方法在审
申请号: | 202010767169.5 | 申请日: | 2020-08-03 |
公开(公告)号: | CN112071362A | 公开(公告)日: | 2020-12-11 |
发明(设计)人: | 刘光明;丁翠;王彬;李爱民;刘雅君;罗靖 | 申请(专利权)人: | 西安理工大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B40/30 |
代理公司: | 西安弘理专利事务所 61214 | 代理人: | 宁文涛 |
地址: | 710048 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明公开了一种融合全局和局部拓扑结构的蛋白质复合体的检测方法,步骤包括:1)获取多种用于实验测试的蛋白质互作网络数据集并对数据集进行预处理;2)将预处理得到的蛋白质互作网络数据集转换成网络对应的邻接矩阵A;3)依据蛋白质互作网络的拓扑特性对非负矩阵分解算法加以改进,构建一种蛋白质复合体检测模型;4)对步骤3所形成的模型加以多次训练和测试;5)对最终输出的蛋白质复合体进行基因的富集分析,为每个蛋白质复合体标注出其代表的生物功能。本发明融合了蛋白质互作网络的全局和局部拓扑特性,使用改进之后的非负矩阵分解算法构建蛋白质复合体检测模型,具有良好的表现优势,能够更加准确高效的检测出蛋白质复合体。 | ||
搜索关键词: | 一种 融合 全局 局部 拓扑 结构 蛋白质 复合体 检测 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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