[发明专利]一种预测siRNA沉默效率的方法在审
申请号: | 202010729971.5 | 申请日: | 2020-07-27 |
公开(公告)号: | CN111986730A | 公开(公告)日: | 2020-11-24 |
发明(设计)人: | 徐迪;张佩珩 | 申请(专利权)人: | 中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G16B40/00;G06N3/04 |
代理公司: | 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 | 代理人: | 陈忠辉 |
地址: | 215123 江苏省苏州市苏州工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明揭示了一种预测siRNA沉默效率的方法,其特征在于:在输入层设置特征提取模块对数据集进行特征提取和处理,使用多模motif输入结合词向量预训练模型获得序列词向量、循环神经网络提取序列的潜在特征并引入注意力模型,利用逻辑回归模块计算得到siRNA沉默效率的预测结果。应用本发明预测siRNA沉默效率的技术解决方案,通过训练得到神经网络模型能提高对输入序列进行预测的效率,为实验人员提供效率上的参考,减少试验次数,降低时间与金钱成本;有利于实现沉默效率预测的量化,并提升预测准确度,模型预测效果在Husken数据集上PCC值达到0.716。 | ||
搜索关键词: | 一种 预测 sirna 沉默 效率 方法 | ||
【主权项】:
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