[发明专利]一种预测siRNA沉默效率的方法在审

专利信息
申请号: 202010729971.5 申请日: 2020-07-27
公开(公告)号: CN111986730A 公开(公告)日: 2020-11-24
发明(设计)人: 徐迪;张佩珩 申请(专利权)人: 中国科学院计算技术研究所苏州智能计算产业技术研究院
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G16B40/00;G06N3/04
代理公司: 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 代理人: 陈忠辉
地址: 215123 江苏省苏州市苏州工*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明揭示了一种预测siRNA沉默效率的方法,其特征在于:在输入层设置特征提取模块对数据集进行特征提取和处理,使用多模motif输入结合词向量预训练模型获得序列词向量、循环神经网络提取序列的潜在特征并引入注意力模型,利用逻辑回归模块计算得到siRNA沉默效率的预测结果。应用本发明预测siRNA沉默效率的技术解决方案,通过训练得到神经网络模型能提高对输入序列进行预测的效率,为实验人员提供效率上的参考,减少试验次数,降低时间与金钱成本;有利于实现沉默效率预测的量化,并提升预测准确度,模型预测效果在Husken数据集上PCC值达到0.716。
搜索关键词: 一种 预测 sirna 沉默 效率 方法
【主权项】:
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