[发明专利]一种用于裂解性多糖单加氧酶(LPMO)分析和鉴定的方法在审
| 申请号： | 202010136315.4 | 申请日： | 2020-03-02 |
| 公开（公告）号： | CN113362908A | 公开（公告）日： | 2021-09-07 |
| 发明（设计）人： | 罗朝兵 | 申请（专利权）人： | 罗朝兵 |
| 主分类号： | G16C20/20 | 分类号： | G16C20/20;G16C20/70;G16C20/90 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 614600 四川省乐山*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明公开了的属于分子生物学、基因组学等研究领域，尤其是一种用于裂解性多糖单加氧酶(LPMO)分析和鉴定的方法，LPMO分析通过CAZy数据库提取出来属于后生动物门(Metazoa)并且被实验验证过的LPMO序列，然后将上述序列与CAZy数据库中的所有动物LPMO候选序列进行比对并过滤，最后用muscle进行多序列比对，并用MEGA提取多序列比对中的保守区域后用于构建隐马尔可夫模型，然后采用hmmbuild构建隐马尔可夫模型，使用meme软件生成多序列比对文件的logo图，能使使用者减少时间和成本，鉴定LPMO采用hmmsearch，基于metazoa.LPMO.hmm模型鉴定昆虫纲(Insecta)各个物种的CAZy酶中的LPMO酶，最后进行比对，分析结果一目了然，不用再花多于时间进行结果分析，极大化的提高了工作效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 裂解 多糖 单加氧酶 lpmo 分析 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
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