[发明专利]面向生物大数据的流式传输与变异实时挖掘系统及方法

摘要

面向生物大数据的流式传输与变异实时挖掘系统及方法，传输层读取数据层中的测序数据文件，通过生物数据流式传输算法生成测序数据流，再将测序数据流，发送给计算层；计算层接收来自传输层的实时测序读段数据，根据基于Map Reduce的删除变异实时挖掘算法，实时计算该局部测序区域是否存在删除变异并输出删除变异的左右端点，并将删除变异的左右端点传输给用户层。通过基于Map Reduce的删除变异实时挖掘算法，根据实时接收到的局部测序数据流，即可实时判断局部区域是否存在删除变异，而不需要整个基因组中的上下文信息，实现了对测序数据的解耦，降低了传统测序数据处理算法对计算资源的高要求和高依赖。