[发明专利]基于scRNA-seq及动态时间规整的基因调控网络构建方法有效
| 申请号： | 201911012024.8 | 申请日： | 2019-10-23 |
| 公开（公告）号： | CN110808083B | 公开（公告）日： | 2023-08-29 |
| 发明（设计）人： | 解刚才;桑蒙蒙 | 申请（专利权）人： | 南通大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B25/00;G16B5/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人： | 朱小兵 |
| 地址： | 226019 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明具体涉及基于scRNA‑seq及动态时间规整的基因调控网络构建方法，属于基因调控网络技术领域。该方法包括以下步骤：步骤1、基于单细胞数据的单细胞伪时间分析；步骤2、基于正负调控方式的双重DTW距离分析；步骤3、基于DTW距离的聚类分析以及GRN模块筛选；步骤4、基于DTW距离的基因间相似性矩阵构建；步骤5、通过随机置换检验，计算出基因与基因间网络连接度阈值C；步骤6、对GRN模块进行基因功能性分析；步骤7、pGRN网络的可视化得出GRN网络图。本发明方法的pGRN能够发现时间调控滞后的调控关系，同时处理时间滞后和时间伸缩的调控关系，为新的调控关系的发掘提供了途径。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 scrna seq 动态 时间 规整 基因 调控 网络 构建 方法 | ||
【主权项】：
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