[发明专利]基于网络融合多组学数据的癌症相关通路识别方法在审
| 申请号： | 201910666306.3 | 申请日： | 2019-07-23 |
| 公开（公告）号： | CN110428866A | 公开（公告）日： | 2019-11-08 |
| 发明（设计）人： | 李杰;张巧生;王亚东 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工业大学 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B25/10;G16B45/00 |
| 代理公司： | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人： | 安琪 |
| 地址： | 150001 黑龙*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 本发明提出了基于网络融合多组学数据的癌症相关通路识别方法，属于计算机应用技术生物信息学技术领域。所述方法首先基于基因表达数据进行基因层次上的统计分析，然后基于融合基因表达数据和DNA甲基化数据扩展后的通路基因集进行基因集层次上的统计分析，最后根据分析结果进行癌症相关通路识别。本发明所述方法具有提高了识别的准确性和精确性等特点。 | ||
| 搜索关键词： | 通路识别 网络融合 统计分析 癌症 组学 计算机应用技术 生物信息学技术 基因表达数据 表达数据 融合基因 数据扩展 通路基因 基因 | ||
【主权项】：
1.基于网络融合多组学数据的癌症相关通路识别方法，其特征在于，所述癌症相关通路识别方法包括：步骤一、构建加权基因交互网络，利用融合DNA甲基化和基因表达数据来计算蛋白质之间的相互作用强度，计算结果作为权重赋予两个基因对应的边；然后将基因交互网络中所有的边权重在不同的表型数据下依次计算完毕，获得两个表型特异性加权基因交互网络；步骤二、利用步骤一构建的基因交互网络进行通路扩展，获得最终扩展通路；步骤三、利用将最终扩展通路与显著表达分析方法和功能类得分方法结合，形成EP‑ORA方法和EP‑GSEA方法，并利用EP‑ORA方法和EP‑GSEA方法进行癌症相关通路的识别，获得癌症相关通路的识别结果。
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