[发明专利]一种基于级联判决系统的CircRNA功能预测方法在审
| 申请号： | 201910246724.7 | 申请日： | 2019-03-29 |
| 公开（公告）号： | CN111755070A | 公开（公告）日： | 2020-10-09 |
| 发明（设计）人： | 邓怡云;朱勉春;戴宪华 | 申请（专利权）人： | 中山大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B20/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 510275 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 为克服现有技术的不足，本发明的目的在于利用所提出的级联判决系统结合LightGBM方法的多分类模型对CircRNA的功能进行预测。本发明所采用的技术方案主要步骤是：(1)将大数据样本的CircRNA以(.bed)文件形式输入。(2)将CircRNA(.bed)文件根据起始位点等相关信息映射，得到CircRNA序列信息(.fasta)文件。(3)提出了一种特征提取和融合的方法，提取CircRNA特征。(4)提出A类判决系统，对编码型CircRNA进行功能预测。(5)利用LightGBM算法对其他CircRNA进行预测。(6)根据lightGBM算法的多分类模型，利用其中的核心算法GOSS、EFB分别进行样本数据的采样和特征抽样，用Histogram‑based算法将连续的特征映射到离散的buckets中，将连续变量离散化。(7)通过调整树的最大深度、叶子最小记录数、每次迭代时用的数据比例等参数，获取模型最佳参数。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 级联 判决 系统 circrna 功能 预测 方法 | ||
【主权项】：
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