[发明专利]一种基因参考序列的去冗余优化方法及系统有效
| 申请号： | 201811591686.0 | 申请日： | 2018-12-25 |
| 公开（公告）号： | CN109658985B | 公开（公告）日： | 2020-07-17 |
| 发明（设计）人： | 李根;宋卓;徐霞丽;冯博伦;赵丽霞;黄能超;毛海波;马丑贤;杨耀 | 申请（专利权）人： | 人和未来生物科技（长沙）有限公司 |
| 主分类号： | G16B50/50 | 分类号： | G16B50/50 |
| 代理公司： | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 | 代理人： | 邹大坚;谭武艺 |
| 地址： | 410000 湖南省长沙市长沙高*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基因参考序列的去冗余优化方法及系统，针对基因参考序列，本发明通过按照指定步长遍历获取指定长度的连续参考序列Kmer，然后通过哈希桶将连续参考序列Kmer进行分散、选择性去冗余，再重新组装，从而在能够尽可能的减少参考序列Kmer的个数的同时保证连续参考序列Kmer的质量，本发明能够在保证尽量不减少压缩率的前提下减少基因参考序列的冗余度，精简出更适合的参考序列，使得优化后的基因参考序列体积更小，被用于做压缩参考索引时加载内存更快，从而提高基因数据的压缩效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基因 参考 序列 冗余 优化 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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