[发明专利]一种基于表型距离的大白菜特异性测试近似品种筛选方法

摘要

本发明公开了一种基于表型距离的大白菜特异性测试近似品种筛选方法。本发明首先选择一批表达状态观测值稳定的性状，然后对每一个入选性状的表达状态代码的所有差值都赋予相应的权重值，建立权重赋值规则；待测的申请品种与已知品种的每个入选性状代码的差值根据上述规则给予权重；将所有入选性状上的权重相加，得出的权重和作为两品种间的表型距离；再通过对大量真实品种间表型距离和差异明显程度的比较分析，确定一个安全的表型距离阈值，小于该安全距离的已知品种作为近似品种与申请品种进行田间相邻种植和特异性评价。采用这种方法，降低了人员观测偏差、数据录入错误和基因型与环境互作等对近似品种筛选的影响，提高了近似品种筛选的严谨性。

主权项

1.一种基于表型距离的大白菜特异性测试近似品种的筛选方法，其特征是，(1)设置各个大白菜表型性状的表达状态代码差值的权重选择表达状态丰富、表达状态观测值相对稳定的表型性状；采集当前仍具有应用潜力的大白菜品种的表型性状数据，对采集的表型性状数据进行整理，建立大白菜品种表型性状数据库；根据各个表型性状的表达状态观测值受环境条件影响的程度和人员观测偏差的大小，对入选的大白菜表型性状的表达状态代码差值设置不同的权重，得到如表1所示的数据，输入表型性状数据库；表1续表1(2)表型距离的计算和近似品种筛选表型距离阈值的设定首先计算两个大白菜品种之间的入选性状表达状态代码差值，根据步骤(1)的方法，得到相应的权重，将所有入选表型性状上的权重相加得出两品种间的表型距离；将大量品种间的表型距离与品种间差异的明显程度进行比较，然后确定一个表型距离阈值，输入大白菜品种表型性状数据库；(3)近似品种筛选基于建立的大白菜品种表型性状数据库，开发基于表型距离的近似品种筛选软件；向大白菜品种表型性状数据库中输入待测的申请品种的表型性状数据，该筛选软件能根据步骤(2)的方法计算待测的申请品种与每个已知品种的表型距离，并与表型距离阈值进行比较，表型距离小于表型距离阈值的已知品种作为该申请品种的近似品种。