[发明专利]一种多酚氧化酶抑制剂的虚拟筛选方法有效
| 申请号： | 201811339952.0 | 申请日： | 2018-11-12 |
| 公开（公告）号： | CN109524064B | 公开（公告）日： | 2020-10-20 |
| 发明（设计）人： | 邹聪明;刘俊军;黄维;陈颐;胡彬彬;李军营;赵高坤;任可;陈妍洁;苏家恩;胡小东 | 申请（专利权）人： | 云南省烟草农业科学研究院 |
| 主分类号： | G16C20/64 | 分类号： | G16C20/64 |
| 代理公司： | 昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业) 53116 | 代理人： | 张玉 |
| 地址： | 650021*** | 国省代码： | 云南;53 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种多酚氧化酶抑制剂的虚拟筛选方法。多酚氧化酶是造成烤烟挂灰的主要因素，抑制多酚氧化酶的活性可显著降低烤烟过程中出现的挂灰情况。本发明采用基于支持向量机算法的机器学习，对多酚氧化酶的抑制剂进行虚拟筛选。与传统的基于药理活性实验的高通量筛选等方法相比，本发明利用计算机将抑制剂筛选的过程在计算机上模拟，对化合物可能的活性作出预测，进而筛选多酚氧化酶的潜在抑制剂，具有成本低、速度快、效率高的特点。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 氧化酶 抑制剂 虚拟 筛选 方法 | ||
【主权项】：
1.一种多酚氧化酶抑制剂的虚拟筛选方法，其特征在于包括以下步骤：S1、训练预测模型：以多酚氧化酶抑制剂的生物活性数据为训练集，利用实现了支持向量机算法的libsvm程序，训练得到多酚氧化酶抑制剂的预测模型；S2、准备筛选数据库：从数据库中获得已上市药物化合物数据，并计算每个药物化合物分子的分子描述符；S3、用预测模型对数据进行筛选：用S1步骤中训练得到的预测模型对S2步骤中准备好的化合物数据库进行筛选，得到潜在的多酚氧化酶抑制剂；S4、多酚氧化酶抑制剂预筛选：先将潜在的多酚氧化酶抑制剂进行预筛选，筛除带负电荷的抑制剂；S5、将经过预筛选的多酚氧化酶抑制剂进行生物活性实验测量IC50值，最终得到筛选出的多酚氧化酶抑制剂。
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