[发明专利]基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201811130259.2 申请日: 2018-09-27
公开(公告)号: CN109187614B 公开(公告)日: 2020-03-06
发明(设计)人: 秦家辉;徐向南;董继扬;许晶晶 申请(专利权)人: 厦门大学
主分类号: G01N24/08 分类号: G01N24/08;G01N30/88
代理公司: 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 代理人: 张松亭;陈丹艳
地址: 361000 *** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用,该方法包括:分别利用核磁共振谱仪和液相色谱‑质谱仪器采集生物样品的代谢轮廓,得到基于核磁共振(NMR)和基于质谱(MS)的两种代谢组学数据;利用Diffreg检验方法,先从MS数据中筛选出对NMR数据具有补充意义的变量,将所筛选的MS变量集与NMR数据集合并;再从新数据集中删除冗余的变量,则所得的数据即为融合数据,便于后续的建模分析。本发明方法得到的模型具有更好的解释与预测性能,且对于其它代谢组学平台的数据融合具有很强的适用性。
搜索关键词: 基于 核磁共振 代谢 数据 融合 方法 及其 应用
【主权项】:
1.基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)样本收集:收集代谢组学研究的实验样品,对实验样品处理得到正常样品A和疾病样品B;(2)数据的收集和处理:对实验样品进行一维核磁共振氢谱和液相色谱‑质谱实验,将得到的谱图进行处理得到每行为实验样本、每列为代谢物信息的二维矩阵,分别为NMR数据集和MS数据集;(3)使用Diffreg检验计算MS数据集中每个变量对NMR数据集的p值,选择Diffreg检验p值小于0.05的或者前10%小的变量,这些变量即为MS数据集中对NMR数据集有补充信息的变量;(4)使用Diffreg检验计算NMR数据集中每个变量对(3)中的补充变量集的p值,保留前10%至20%小的变量,将新得到的NMR补充变量集与(3)中的MS补充变量结合起来,所得的新数据集即为核磁共振与质谱的融合数据。
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