[发明专利]一种改进的基于协同过滤的miRNA-疾病关联预测方法有效
| 申请号： | 201710902248.0 | 申请日： | 2017-09-29 |
| 公开（公告）号： | CN107506608B | 公开（公告）日： | 2020-09-29 |
| 发明（设计）人： | 颜成钢;俞灵慧;刘炳涛;施海南;邵碧尧;李志胜 | 申请（专利权）人： | 杭州电子科技大学 |
| 主分类号： | G16H50/50 | 分类号： | G16H50/50;G16B40/20 |
| 代理公司： | 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 | 代理人： | 朱月芬 |
| 地址： | 310018 浙*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种改进的基于协同过滤的miRNA‑疾病关联预测方法。miRNA‑疾病预测问题可以看作是一种推荐修补问题。基于已知miRNA疾病关联的二分网络，根据miRNA对相关疾病的已知偏好，推荐使用miRNA，反之亦然。首先定义和计算测量一种疾病对另一种疾病的重要性矩阵SIGd。当疾病d(i)认为疾病d(j)更重要时，SIGd(d(i),d(j))的得分更高。类似地定义和计算SIGr以测量两种miRNA的重要性。其次使用显著矩阵和相似矩阵作为权重来计算得分。相似性矩阵被定义为表示miRNA或疾病之间的相似性，则miRNA‑疾病关联的最终得分是miRNA与疾病的评分分数和该疾病对miRNA的评分评分的总和。本发明实现了更高的预测精度。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 改进 基于 协同 过滤 mirna 疾病 关联 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种改进的基于协同过滤的miRNA‑疾病关联预测方法，其特征在于将miRNA‑疾病预测问题看作是一种推荐修补问题；基于已知miRNA疾病关联的二分网络，根据miRNA对相关疾病的已知偏好，推荐使用miRNA，反之亦然；通过整合相似的疾病语义，将miRNA功能相似性纳入网络工作并建立孤立顶点；具体的：首先定义和计算测量一种疾病对另一种疾病的重要性矩阵SIGd；当疾病d(i)认为疾病d(j)更重要时，SIGd(d(i),d(j))的得分更高；当一种疾病在评估潜在相关的miRNA时，会从对miRNA的优先性高度重视的疾病中获得更多的建议；类似地定义和计算SIGr以测量两种miRNA的重要性；其次使用显著矩阵和相似矩阵作为权重来计算得分；相似性矩阵被定义为表示miRNA或疾病之间的相似性，则miRNA‑疾病关联的最终得分是miRNA与疾病的评分分数和该疾病对miRNA的评分评分的总和。
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