[发明专利]基于MALDI-TOF质谱数据鉴定细菌混合样品的算法有效
| 申请号： | 201710517246.X | 申请日： | 2017-06-29 |
| 公开（公告）号： | CN107271533B | 公开（公告）日： | 2019-09-13 |
| 发明（设计）人： | 余绍宁 | 申请（专利权）人： | 浙江和谱生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G01N27/62 | 分类号： | G01N27/62 |
| 代理公司： | 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 | 代理人： | 姚宇吉 |
| 地址： | 310000 浙江省杭州市滨江*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明提供基于MALDI‑TOF质谱数据鉴定细菌混合样品的算法，包括以下步骤：(1)利用参考数据库中的候选图谱合成模拟混合图谱；(2)评价实验图谱与模拟混合图谱的相似度，选出最可能匹配结果；(3)利用“随机图谱模型法”计算错误检出率。本发明构建的细菌混合样品鉴定算法，实现混合细菌样本的直接鉴定，避免了传统方法步骤繁琐、耗时较长的问题；引入了综合评价样品谱图搜库匹配结果的假设验证方法，以FDR值作为鉴定的阈值，提高了基于谱图相似度计算的搜库匹配结果的可靠性；具有较好的综合评价能力，具有较强的可操作性和实用性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 maldi tof 数据 鉴定 细菌 混合 样品 算法 | ||
【主权项】：
1.一种基于MALDI‑TOF质谱数据鉴定细菌混合样品的算法，其特征在于，该算法包括以下步骤：(1)利用参考数据库中的候选图谱合成模拟混合图谱；(2)评价实验图谱与模拟混合图谱的相似度，选出最可能匹配结果；(3)利用随机图谱模型法计算错误检出率；利用参考数据库中的候选图谱合成模拟混合图谱包括以下步骤：(1)将实验图谱与候选参考图谱进行峰对齐，得到峰强度矩阵；(2)将实验图谱sm的峰强度视为候选参考图谱si对应的峰强度的非负线性组合![]()
应用非负线性最小二乘法求解各组分的系数ci；(3)根据最小二乘法结果合成模拟混合图谱。
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