[发明专利]一种基于PSP的适用于高通量测序中elRNA文库构建方法有效

专利信息
申请号: 201710232986.9 申请日: 2017-04-11
公开(公告)号: CN106939306B 公开(公告)日: 2019-05-24
发明(设计)人: 曹振龙;冷小健;刘少卿;邢红兵 申请(专利权)人: 江苏吉诺思美精准医学科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 徐冬涛;李晓峰
地址: 210046 江苏省南京市经*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开一种基于PSP的适用于高通量测序中elRNA文库构建方法。包括以下步骤:(1)以elRNA为样品来源;(2)采用去除核糖体方法进行文库构建至PCR反应之前;(3)采用PSP文库富集技术进行两轮PCR扩增。在高通量测序中,随着该技术的发展,面临的样品问题越来越严重,在外泌体包裹的RNA中,尤其是外泌体大RNA(exosome large RNA,elRNA),含量相当稀少。针对这种情况,本发明借助于PSP文库富集技术,形成一种适用于elRNA的文库构建方法。该方法操作流程简单,能够获得满足高通量测序所需的文库。
搜索关键词: 一种 基于 psp 适用于 通量 测序中 elrna 文库 构建 方法
【主权项】:
1.一种基于PSP的适用于高通量测序中elRNA文库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)以elRNA为样品来源;(2)采用去除核糖体方法进行文库构建至PCR反应之前,该过程包括以下步骤:(Ⅰ)对外泌体Total RNA进行核糖体RNA去除;(Ⅱ)对步骤(Ⅰ)所得RNA进行高温、高盐打断;(Ⅲ)对步骤(Ⅱ)所得产物进行逆转录成双链cDNA,并进行纯化;(Ⅳ)对步骤(Ⅲ)所得产物进行末端修复、3`末端加A、加接头,并进行纯化;(3)采用PSP文库富集技术进行两轮PCR扩增;所述的PSP文库富集技术依次包括第一轮PCR扩增、片段分选或DNA纯化、第二轮PCR扩增三个步骤;所述第一轮PCR扩增的循环数为建库流程中建议循环数的一半,所述第二轮PCR扩增的循环数为建库流程中建议循环数的另一半。
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