[发明专利]基于转录测序获得黑果枸杞SSR引物的方法有效
申请号: | 201710038608.7 | 申请日: | 2017-01-19 |
公开(公告)号: | CN106754886B | 公开(公告)日: | 2019-12-03 |
发明(设计)人: | 陈金焕;张东智;饶书培 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/11;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12Q1/6895 |
代理公司: | 11237 北京市广友专利事务所有限责任公司 | 代理人: | 张仲波<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于转录测序获得黑果枸杞SSR引物的方法,属于生物学分子遗传分子标记技术技术领域,其步骤如下:(1)转录组测序;(2)筛选EST‑SSR位点;(3)引物设计;(4)提取DNA;(5)引物筛选;(6)使用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行多态性引物筛选。本发明的基于转录测序获得黑果枸杞SSR引物的方法,可作为校正远亲物种间基因组连锁图谱与比较作图的方法,在这两方面有较高的利用价值。其最大的优点是开发简单、快捷、费用低。利用SSR分子标记技术明确黑果枸杞SSR的总体特点,开发黑果枸杞SSR引物,为利用SSR分子标记进行黑果枸杞种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础,从而更好地应用在分子育种中。 | ||
搜索关键词: | 基于 转录 获得 枸杞 ssr 引物 方法 | ||
【主权项】:
1.鉴定黑果枸杞品种的引物组,其特征在于:包括11对SSR引物:/n(1)U20/n上游引物:CCCACTTCTCAAAAATGGTACAC,下游引物:ATAGTTGCCAACAAACCCTTCTT;/n(2)U21/n上游引物:GGATGAAGAAGAAGAGGATGACA,下游引物:CTTCTCAAAAATGGTACACTGCC;/n(3)U23/n上游引物:CTACTTCCATTTGTGGAAAGCTG,下游引物:TAGCCAGTCTAATCTTCGGTTTG;/n(4)U25/n上游引物:CAGGAAGGAGAAGAGTCTGATGA,下游引物:TTATCATTAACGGCTTCCATTTG;/n(5)U26/n上游引物:AATGGGGAAAGGTAAAGGAAGTT,下游引物:CCTTGTGGAATTTTACTTTCCAAT;/n(6)U27/n上游引物:CCACCCAGATAGTGGTGGTAATA,下游引物:GCTGATGTTTTCACATTTGTCAC;/n(7)U31/n上游引物:TAGGGTTTGAGGGTTTGAAGAAT,下游引物:ATTATTATGGCTTCTTCACCTGG;/n(8)U36/n上游引物:CTACCACTCCAACGTGTACCAAT,下游引物:TTCTTGCTCTAATTCTGAAACCG;/n(9)U42/n上游引物:GTCTCCATTTTACCCCTACCAAG,下游引物:TTTGCAAATAAAATGCGATTATTG;/n(10)U46/n上游引物:ATGAAGGCAATATTTAGGGCAGT,下游引物:CAATTTCATATTTGTGCTCTGCAT;/n(11)D1/n上游引物:TTCCAAGAACATTAGCACAAACA,下游引物:TGGCACTTGTCCTAGTCCTAAAC。/n
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