[发明专利]下一代测序数据的存储、传输和压缩在审

专利信息
申请号: 201680042553.0 申请日: 2016-05-02
公开(公告)号: CN107851118A 公开(公告)日: 2018-03-27
发明(设计)人: 达恩·萨德;沙伊·卢布林尔;阿里·凯舍特;埃兰·西格尔;伊塔·西拉 申请(专利权)人: 基因福米卡数据系统有限公司
主分类号: G06F17/30 分类号: G06F17/30;G06F19/22;G06F19/28
代理公司: 北京金思港知识产权代理有限公司11349 代理人: 邵毓琴
地址: 以色列拉*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 一种计算机设备,该计算机设备包括前端接口,该前端接口与客户端计算机通信;后端接口,该后端接口与存储器通信;压缩器,该压缩器借助于所述前端接口从在客户端计算机上运行的应用接收原生下一代测序(NGS)数据,所述应用被编程以对原生NGS数据进行处理,将所述原生NGS数据的压缩形式添加至编码数据文件或数据对象的一部分中,并且借助于所述后端接口将所述编码数据文件或数据对象的所述一部分存储在所述存储器中;和解压器,该解压器借助于所述后端接口从所述存储器接收编码数据文件或数据对象的一部分,将所述编码数据文件或数据对象的所述一部分解压以由此生成原生NGS数据,并且借助于所述前端接口将所述原生NGS数据发送至所述客户端,以供在所述客户端上运行的所述应用使用。
搜索关键词: 下一代 序数 存储 传输 压缩
【主权项】:
一种用于下一代测序数据即NGS数据的存储、传输和压缩的计算机设备,该计算机设备包括:前端接口,该前端接口通过第一存储访问协议与客户端计算机通信;后端接口,该后端接口通过第二存储访问协议与存储系统通信;压缩器,该压缩器借助于所述前端接口从在所述客户端计算机上运行的应用接收原生NGS数据,所述应用被编程以对原生NGS数据进行处理,将所述原生NGS数据的压缩形式添加至编码数据文件或数据对象的一部分中,并且借助于所述后端接口将所述编码数据文件或数据对象的所述一部分存储在所述存储系统中;和解压器,该解压器借助于所述后端接口从所述存储系统接收编码数据文件或数据对象的一部分,将所述编码数据文件或数据对象的所述一部分解压以由此生成原生NGS数据,并且借助于所述前端接口将所述原生NGS数据发送至所述客户端,以供在所述客户端上运行的所述应用使用。
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