[发明专利]一种污水处理系统中水/泥样品DNA扩增子测序文库快速构建的引物及快速构建方法在审

专利信息
申请号: 201611071680.1 申请日: 2016-11-29
公开(公告)号: CN106554958A 公开(公告)日: 2017-04-05
发明(设计)人: 张徐祥;汤俊英;任洪强 申请(专利权)人: 南京大学宜兴环保研究院;南京大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/68;C40B50/06
代理公司: 南京知识律师事务所32207 代理人: 蒋海军
地址: 214200 江苏省无锡市宜*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种污水处理系统中水/泥样品DNA扩增子测序文库快速构建的引物及快速构建方法,属于高通量测序领域。本发明的步骤为一、样品DNA的提取;二、目的片段的扩增;三、扩增产物的纯化;四、扩增产物的质量鉴定;五、扩增产物的混合;六、混合文库的质量鉴定;七、混合文库的准备及测序。本发明公开了一种引物,包括接头序列、索引序列、异质性间隔序列、目的片段扩增序列,使得利用该引物经一步扩增能够快速完成文库的构建,降低了测序成本、大量节省文库构建时间。本发明克服了复杂污水/泥样品中高多样性菌群结构解析难题,满足了基于高通量DNA测序技术应用于污水处理系统中水/泥样品菌群深度解析的技术需求。
搜索关键词: 一种 污水处理 系统 中水 样品 dna 扩增 序文 快速 构建 引物 方法
【主权项】:
一种污水处理系统中水/泥样品DNA扩增子测序文库快速构建的引物,包括上游引物和下游引物,其特征在于:所述的上游引物和下游引物按照从5’端至3’端的顺序均包括接头序列、索引序列、异质性间隔序列、目的片段扩增序列;所述的接头序列中包含测序引物序列;所述的索引序列由12个碱基组成;所述的异质性间隔序由0‑4bp的碱基组成;所述的目的片段扩增序列为16S rDNA高可变区处:341F和806R。
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