[发明专利]一种基于集群的高通量数据分析方法有效
申请号: | 201610788828.7 | 申请日: | 2016-08-31 |
公开(公告)号: | CN106407743B | 公开(公告)日: | 2019-03-05 |
发明(设计)人: | 杨飞;陈昌岳;任一;占雪峰;张祥林 | 申请(专利权)人: | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 孟旭彤 |
地址: | 201203 上海市浦东新区*** | 国省代码: | 上海;31 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 一种高通量数据分析方法,一种高通量数据分析方法,对高通量测序下机数据的处理包括:对下机数据进行数据分割;在对下机数据进行数据分割后,生成多个前数据片文件,在与参考基因组的所以比对完成后,将生成的多个比对结果片文件合并为一个比对结果文件;预先指定一个区域文件,将其分割成指定的多个区域子文件;将所述比对结果文件根据指定的多个区域子文件抽取数据进行再次分割,生成多个后数据片文件,提供给后续步骤处理。对于分割后获得的多个数据片的运算处理,采用集群管理工具分配包括计算节点,以及相应的CPU和内存的计算资源。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 集群 通量 数据 分析 方法 | ||
【主权项】:
1.一种高通量数据分析方法,其特征在于,对高通量测序下机数据的处理包括:对下机数据进行数据分割;在对下机数据进行数据分割后,生成多个前数据片文件,在与参考基因组的所有比对完成后,将生成的多个比对结果片文件合并为一个总比对文件;预先指定一个区域文件,将其分割成指定的多个区域子文件;将所述总比对文件根据指定的多个区域子文件抽取数据进行再次分割,生成多个后数据片文件,提供给后续步骤处理;对于分割后获得的多个数据片的运算处理,采用集群管理工具分配包括计算节点,以及相应的CPU和内存的计算资源。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海美吉生物医药科技有限公司,未经上海美吉生物医药科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201610788828.7/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法、数据系统、接收设备和数据读取方法
- 数据记录方法、数据记录装置、数据记录媒体、数据重播方法和数据重播装置
- 数据发送方法、数据发送系统、数据发送装置以及数据结构
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法及数据系统
- 数据嵌入装置、数据嵌入方法、数据提取装置及数据提取方法
- 数据管理装置、数据编辑装置、数据阅览装置、数据管理方法、数据编辑方法以及数据阅览方法
- 数据发送和数据接收设备、数据发送和数据接收方法
- 数据发送装置、数据接收装置、数据收发系统、数据发送方法、数据接收方法和数据收发方法
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置