[发明专利]一种将环境监测分析数据提取到LIMS的方法及装置

摘要

本发明公开了一种将环境监测分析数据提取到LIMS的方法及装置，方法包括：数据采集终端定时轮询检测接口数据文件，发生变化时，将其存储到备份目录中，将备份成功的接口数据文件解析生成结构化的分析结果数据；建立与数据存储服务器的连接，记录新增数据的数量和更新数据的数量并将其上传到数据存储服务器，并在上传成功后将备份的接口数据文件传输到数据存储服务器；LIMS自动将确定后的结构化的分析结果数据提取到原始分析记录中。实施本发明的将环境监测分析数据提取到LIMS的方法及装置，具有以下有益效果：故障率较低、数据传递效率较高、能自动扫描本地文件数据、能将数据实时提交到LIMS、能记录数据提交及被应用情况。

主权项

1.一种将环境监测分析数据提取到LIMS的方法，其特征在于，包括如下步骤：A)在分析仪器上安装工作站软件，在所述工作站软件上部署数据采集终端，并配置相应的参数；数据采集终端是指为了实现实时、稳定、准确地采集分析仪器的接口数据文件而开发的Windows C/S架构程序；B)启动所述工作站软件，所述数据采集终端也相应自行启动；C)所述数据采集终端定时轮询检测所述工作站软件生成的接口数据文件，并判断所述接口数据文件是否发生变化，如是，将所述接口数据文件通过顺序读取的模式复制到所述数据采集终端在本地自动生成的备份目录中，执行步骤D)；否则，继续进行本步骤的判断；数据采集终端在轮询检测时，是按照配置的数据扫描的频率、备份目录和数据解析程序，定期扫描分析仪器的工作站软件的文件或数据库；D)备份成功后，所述数据采集终端读取备份成功的接口数据文件，对其解析后生成结构化的分析结果数据，并将所述结构化的分析结果数据存储在所述数据采集终端自带的数据库中进行缓存；E)建立所述工作站软件与数据存储服务器的连接，逐条判定所述结构化的分析结果数据是否已经传输过，并记录新增数据的数量和更新数据的数量后形成此次检测的结果；F)分析人员通过所述数据采集终端的界面确认后，将所述新增数据和更新数据上传到所述数据存储服务器，并在上传成功后将所述备份的接口数据文件传输到所述数据存储服务器；数据存储服务器是统一、集中存储全站各种不同类型分析仪器的物理或逻辑的服务器；在该数据存储服务器上安装了MongoDB数据库，实现对异构的结构化的分析结果数据和非结构化的分析仪器的原始分析结果数据文件、图谱和光谱类型文件的存储；同时也为LIMS使用结构化的分析结果数据提供了统一的接口；G)所述分析人员使用其办公电脑上的LIMS下载所述结构化的分析结果数据，经所述LIMS的界面确定所述结构化的分析结果数据无误后，所述LIMS自动将确定后的所述结构化的分析结果数据提取到所述LIMS的原始分析记录中；所述步骤A)进一步包括：A1)在所述分析仪器上安装工作站软件，在所述工作站软件上安装所述数据采集终端；A2)配置数据提交的目标服务器的信息；所述目标服务器的信息包括所述目标服务器的IP地址、端口、数据库名、数据库用户名和数据库密码；A3)配置所述数据采集终端轮询所述接口数据文件的频率；A4)设置所述分析仪器的参数；所述分析仪器的参数包括仪器厂商、仪器型号和仪器编号；A5)配置所述接口数据文件的备份目录；A6)配置所述分析仪器对应的分析项目、数据提取规则、计算规则及数据提取的脚本内容；对于复杂的数据提取逻辑，支持通过JavaScript代码的方式实现扩展；所述接口数据文件包括分析仪器的数据、图谱和光谱数据；所述步骤G)进一步包括：G1)所述分析人员在所述LIMS下载所述结构化的分析结果数据，经所述LIMS的界面确定所述结构化的分析结果数据无误后，按照所述数据提取规则对所述LIMS中的分析项目与所述接口数据文件进行匹配；G2)使用Javascript进行数据提取脚本的编写，将数据提取逻辑计算结果转入实体对象；G3)所述分析人员在所述LIMS中填写分析记录的过程中，通过所述LIMS将所述数据采集终端提交的结构化的分析结果数据展示出来，由所述分析人员对所述结构化的分析结果数据进行一键提取。