[发明专利]用于选择和去选择用产生免疫应答的疗法治疗的癌症患者的质谱方法

摘要

一种用于在治疗前预测癌症患者是否有可能或不可能从施用基于酵母的免疫应答生成型治疗中受益的方法和系统，所述治疗可以是单独或联合另一种抗癌治疗的针对基于突变Ras癌症的基于酵母的免疫治疗。本方法使用血液来源的患者样品的质谱和配置为分类器的计算机，所述分类器使用来自从单独或联合另一种抗癌治疗的免疫应答生成型治疗中受益或未受益的其他癌症患者的分类标签谱的训练集。还公开了治疗癌症患者的方法，包括对根据本文公开的预测性质谱方法测出的患者施用基于酵母的免疫应答生成型治疗(其可以是针对基于突变Ras癌症的基于酵母的免疫治疗)，其中所述谱的分类标签表明该患者很有可能从该基于酵母的免疫治疗中受益。

主权项

质谱仪在制备系统中的用途，所述系统用于执行预测癌症患者是否可能从单独或配合另一抗癌治疗施用的针对癌症的基于酵母的免疫应答生成型治疗中受益的方法，其中所述方法包括如下步骤：(a)获得患者血液来源的样品；(b)使用所述质谱仪对该样品进行质谱测定并从该样品获得质谱；并且(c)在程序计算机中，对来自所述样品的质谱执行一个或多个预定义的预处理步骤，在执行预处理步骤之后，在预定义的m/z范围内获取来自所述样品的质谱中所选特征的累积强度值，并将累积强度值与包括来自其他癌症患者的分类标签质谱(class‑labeled mass spectra)的训练集进行比较并用分类标签对来自所述样品的质谱进行分级；其中该分类标签预测患者是否有可能从单独或配合其它抗癌治疗进行的基于酵母的免疫应答生成型治疗中受益。