[发明专利]结肠癌基因表达签名及使用方法

摘要

提供了结肠癌基因表达签名，包括它们的微阵列以及使用所述结肠基因表达签名的方法。所述基因表达签名特别用于确定诊断患有结肠癌、例如II期结肠癌的患者的预后。本文描述的基因签名还用于确定有或没有辅助化疗的手术切除的有效性，并且确定患有结肠癌的患者中癌症复发的可能性。

主权项

一种用于检测获自受试者的包含核酸的样本中表6所列的至少100种结肠癌相关核酸分子的表达水平的试剂在制备用于诊断获自所述受试者的所述样本中结肠癌的诊断剂中的用途，其中所述至少100种结肠癌相关核酸分子的组合的表达水平或从其导出的决策评分被与指示结肠癌诊断的对照阈值比较，其中在所述阈值同侧的表达水平或从其导出的决策评分指示结肠癌的诊断，从而诊断获自所述受试者的所述样本中的结肠癌，其中所述至少100种结肠癌相关核酸分子包括表1中所列的10个转录物，并且其中所述至少100种结肠癌相关核酸分子不包括EFNA3、IGF1、CTSD、PTK2、AXIN2、CTGF、CHD2、ITGA6、RUNX1、ID2、HMGB1、VDR、EPHB4、PKM2、CHD2、SOD2、IGFBP2、GRB7、DSP、ICAM1、BMP2、BMPR1A、CYP1B1、IGF2、NOTCH2、NOTCH2NL、BUB3、MMP1、DSP、JUN、TCF7L2、FLT1、CEACAM6、GBP1、EPHB4、BMPR1A、XPC、PTK2、RALBP1、STAT1、FOXO3、RTEL1、TNFRSF6B、CTSD、EGFR、HIF1A、KLF6、STAT1或MUC2。