[发明专利]鉴定疾病风险因子的方法

摘要

本文中提供的是一种用于鉴定与感兴趣疾患(例如阿尔茨海默氏病)形成有关的遗传变体的方法及如此鉴定的遗传变体。还提供了在检测到本文中所描述的遗传变体后，用活性剂(例如用特定活性剂和/或在较早的年龄)治疗的方法。在一些实施方案中，所述遗传变体是TOMM40基因的删除/插入多态性(DIP)。还提供了用于确定受试者是否处于晚期发作阿尔茨海默氏病形成风险升高的试剂盒。进一步提供了用于确定受试者是否会对用活性剂治疗感兴趣疾患有响应的试剂盒。

主权项

一种用于鉴定与感兴趣疾患形成有关的遗传变体的方法，包括：(a)根据含有DNA的生物学样品测定由多名人类受试者个体在感兴趣遗传基因座处携带的核苷酸序列，其中所述受试者包括(i)受感兴趣疾患影响的受试者和(ii)未受感兴趣疾患影响的受试者二者；(b)实施多重序列比对分析以自在所述多名受试者中观察到的核苷酸序列鉴定所述遗传基因座处的遗传变体；(c)将所述遗传变体绘图以构建所述受试者的系统发生树，所述树包含鉴定同一顺反子上所述受试者间变体变化的分支；(d)检查所述树中作为分支呈现的遗传变体并确定受影响的与未受影响的受试者之比以鉴定那些导致受影响与未受影响受试者之比变化的变化；和然后(e)鉴定受影响与未受影响受试者之比与所述树上一种或多种邻近变体相差至少5％的遗传变体以由此鉴定与所述感兴趣疾患形成有关的遗传变体。