[发明专利]发现新基因的方法和使用的计算机系统平台以及新基因无效
| 申请号： | 200610089339.9 | 申请日： | 2006-06-21 |
| 公开（公告）号： | CN1884521A | 公开（公告）日： | 2006-12-27 |
| 发明（设计）人： | 于在林;郑志华;唐元华;富岩 | 申请（专利权）人： | 北京未名福源基因药物研究中心有限公司;天津溥瀛生物技术有限公司;美国福源集团 |
| 主分类号： | C12N15/09 | 分类号： | C12N15/09;G06F19/00;C12N15/12;C12Q1/68;A61K48/00;A61P9/00;C07K14/435;A61K38/17;G01N33/68 |
| 代理公司： | 北京三友知识产权代理有限公司 | 代理人： | 丁香兰;赵晓梅 |
| 地址： | 100085北京*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一个利用生物信息学分析，计算机模拟预测技术和分子生物学技术来发现新基因的计算机分析系统平台。特别是本发明利用已知的人类基因组序列资料，通过自编程序和分析途经，获得了一种便捷和有效的计算机分析和预测手段，发现和制备了一系列的具有生物学功能的新基因。本发明同时还公开了两个新发现的类似于人载脂蛋白A1BP的基因，命名为：BFC06016和BFC06104，它们在GenBank的登录号分别为：DQ778079和DQ778080。这两个基因及所编码的蛋白质可能与胆固醇在体内代谢相关，可作为人类心血管疾病诊断与治疗的候选药靶基因或作为基因药物而具有临床应用意义。 | ||
| 搜索关键词： | 发现 基因 方法 使用 计算机系统 平台 以及 | ||
【主权项】：
1、一种发现新基因的方法，该方法包括以下步骤：1)从已公开发表的蛋白质序列数据库中获取长度小于300AA或400AA或500AA，首选的是300AA、优选的是400AA、更优选的是500AA的所有蛋白质序列，并将这些序列转为统一格式；2)对上述蛋白质序列进行批量跨膜区域分析从中排除含有跨膜区域的所有序列；3)对保留的序列批量进行分泌型信号肽分析；4)将获取的序列片段作为模型对表达序列标签文库作比对，获得具有一定匹配的表达序列标签；5)对表达序列标签进行拼接；和6)与已知数据库的序列进行比较，获得新的全长基因。
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