本发明公开了一种与桃果形性状共分离的染色体倒位及其应用，涉及植物分子生物学技术。与桃果形性状共分离的染色体倒位近断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，远断点附近核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。利用倒位断点两侧核苷酸序列设计分子标记，用于育种中的标记辅助筛选，能提前筛选果形性状。所述的引物序列如SEQ ID NO.5、6……10所示。本发明具有下列优点和积极效果：①本发明揭示的S基因座大片段染色体倒位更有可能是导致桃果形发生扁平突变的关键原因；②本发明利用包含三对引物的分子标记能对个体果形性状做到精确判断或预测；③本发明找到的控制扁平果形的染色体倒位用于标记辅助选择，指导桃的杂交育种，能提前进行筛选，节约育种时间，提高育种效率。
本发明公开了一种控制苹果果实中柠檬酸含量的二羧酸转运体基因及其应用，涉及苹果分子遗传育种领域。控制苹果果实柠檬酸含量的二羧酸转运体基因MdTDT：基因序列如SEQ ID NO.1所示，基因编码的蛋白序列如SEQ ID NO.2所示。其应用是：通过转基因方法提高或降低该基因表达水平以获取期望的果实柠檬酸含量的性状。本发明具有下列优点和积极效果：①鉴定到的MdTDT基因是导致苹果果实中柠檬酸含量差异的关键基因；②利用CA1‑dCAPS分子标记能预测苹果果实中柠檬酸含量高低；③利用CA1‑dCAPS分子标记可以指导苹果的杂交育种，能提前进行筛选，节约育种时间，提高育种效率。
本发明公开了一种控制苹果果实山梨醇含量的糖转运体基因及其应用，涉及果树分子遗传育种技术。该糖转运体基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码的蛋白质序列如SEQ ID NO.2所示；所述SNP位点的dCAPS分子标记，其上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。本发明针对控制苹果果实山梨醇含量性状的MdSOT2基因开发了1个dCAPS分子标记，利用这个标记指导苹果的杂交育种，能提前进行筛选，节约育种时间，提高育种效率；本发明找到的控制苹果果实山梨醇积累的关键基因MdSOT2可以在未来通过转基因技术或者杂交育种的方法来调控果实山梨醇的含量，将会为苹果新种质的创制提供重要的遗传资源。
