本发明涉及微生物和新型医药领域,具体为一种生物活性次级代谢产物及其制备和应用。生物活性次级代谢产物为下述化合物1‑7(seco‑4‑epi‑7‑epi‑brefeldin A methyl ester(1),4‑epi‑7‑epi‑brefeldin A seco‑acid(2),4‑epi‑6‑epi‑hydroxy‑brefeldin C(3),peniorcinols A‑C(4‑6)和penipentenone A(7));同时通过植物内生真菌F4a发酵培养纯化获得生物活性次级代谢产物(化合物1‑20)。本发明提供的真菌次级代谢产物具有显著的抗肿瘤、降血糖、抗氧化或己糖激酶抑制活性,它们可作为抗肿瘤、降血糖或抗氧化等的理想候选化合物。所述的化合物能通过真菌发酵生产,其制备方法简单、高效,所得产物纯度高。该发明具有良好的应用前景。