本发明公开了一种利用SSR指纹图谱鉴别柿大茶品种的方法,所涉及的茶树全基因组中特异的SSR位点及其两侧的保守序列如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:3。利用四份柿大茶优良品种作为样本材料,包括柿大茶1号、柿大茶2号、柿大茶6号和柿大茶黄种,在茶树全基因组中选取450对SSR引物进行多态性筛选,鉴定的流程主要有茶树总DNA提取、引物的设计、PCR扩增、等位基因多态性统计,最终确立了1对引物作为种鉴定的核心引物,有效的将四种柿大茶品种完全区分开,不仅有利于对柿大茶品种的保护和推广,同时,为市场上出售的各种宣称以柿大茶鲜叶为原料制成的茶叶,提供了一个快速、准确的鉴别方法。