本发明涉及有机磷酯水解酶、突变体、编码基因及其在有机磷农药降解中的应用;本发明的有机磷酯水解酶PoOPH来源于食油假单胞菌,其突变体是在具有如序列表中SEQ ID No.1所示氨基酸序列的蛋白质的第250位和第263位氨基酸经过单位点取代或双位点取代获得的具有有机磷酯水解酶活性的由其衍生的蛋白质。相较于母本,本发明中的PoOPH突变体对甲基对硫磷和乙基对氧磷的催化活性分别提高了5680倍和37.5倍,同时PoOPH突变体保持了母本优良的热稳定性,本发明中的PoOPH突变体同时具备活力高和热稳定性佳两种属性,在降解有机磷农药领域具有很好的应用前景。