本发明属于生物医学工程技术领域，具体涉及一种Beclin1突变蛋白及其制备方法和应用。该Beclin1突变蛋白具有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列；或如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列经缺失、插入或替换所获得的具有相同功能的氨基酸序列。其制备方法包括：获得编码Beclin1突变蛋白的核苷酸序列；将该核苷酸序列插入pET载体中得重组质粒；将该重组质粒转化大肠杆菌BL21，并进行异源表达培养；提取该大肠杆菌BL21异源表达的Beclin1突变蛋白。该Beclin1突变蛋白在细胞内高效表达后，导致表型上的自噬抑制，因此，其具有在治疗自噬相关疾病的相关药物开发价值。
